- Akademi Ilmu Pengetahuan Indonesia
- Badan Amil Zakat Nasional
- Badan Koordinasi Nasional Penyuluhan Pertanian, Perikanan dan Kehutanan
- Badan Koordinasi Pemberantasan Rupiah Palsu
- Badan Koordinasi Penyuluhan
- Badan Nasional Pengelola Perbatasan
- Badan Nasional Sertifikasi Profesi
- Badan Olahraga Profesional
- Badan Otorita Danau Toba
- Badan Pelaksana Penyuluhan
- Badan Pendukung Pengembangan Sistem Penyediaan Air Minum
- Badan Pengatur Hilir Minyak dan Gas
- Badan Pengawas Pasar Tenaga Listrik
- Badan Pengawas Pemilihan Umum
- Badan Pengawas Rumah Sakit
- Badan Pengelola (Perbatasan) di Tingkat Daerah
- Badan Pengembangan Wilayah Surabaya-Madura
- Badan Pengusahaan Kawasan Perdagangan Bebas dan Pelabuhan Bebas Batam
- Badan Pengusahaan Kawasan Perdagangan Bebas dan Pelabuhan Bebas Bintan
- Badan Pengusahaan Kawasan Perdagangan Bebas dan Pelabuhan Bebas Karimun
- Badan Pengusahaan Kawasan Perdagangan Bebas dan Pelabuhan Sabang
- Badan Perfilman Indonesia
- Badan Perlindungan Konsumen Nasional
- Badan Pertimbangan Aparatur Sipil Negara
- Badan Pertimbangan Kepegawaian
- Badan Pertimbangan Kesehatan Nasional
- Badan Pertimbangan Perfilman Nasional
- Badan Pertimbangan Telekomunikasi
- Badan Promosi Pariwisata Indonesia
- Badan Regulasi Telekomunikasi Indonesia
- Badan Restorasi Gambut
- Badan Standardisasi dan Akreditasi Nasional Keolahragaan
- Dewan Energi Nasional
- Dewan Gelar, Tanda Jasa, dan Tanda Kehormatan
- Dewan Insinyur Indonesia
- Dewan Jaminan Sosial Nasional
- Dewan Kawasan Perdagangan Bebas dan Pelabuhan Bebas Batam
- Dewan Kawasan Perdagangan Bebas dan Pelabuhan Bebas Bintan
- Dewan Kawasan Perdagangan Bebas dan Pelabuhan Bebas Karimun
- Dewan Kawasan Perdagangan Bebas dan Pelabuhan Bebas Sabang
- Dewan Ketahanan Nasional
- Dewan Ketahanan Pangan
- Dewan Nasional Ekonomi Khusus
- Dewan Pengupahan Nasional
- Dewan Pers
- Dewan Pertahanan Nasional
- Dewan Pertimbangan Otonomi Daerah
- Dewan Pertimbangan Presiden
- Dewan Riset Nasional
- Dewan Sumber Daya Air Nasional
- Dewan Teknologi Informasi dan Komunikasi Nasional
- Kantor Staf Presiden
- Komisi Aparatur Sipil Negara
- Komisi Banding Merek
- Komisi Banding Paten
- Komisi Informasi
- Komisi Keamanan Hayati Produk Rekayasa Genetik
- Komisi Kejaksaan
- Komisi Kepolisian Nasional
- Komisi Nasional Anti Kekerasan terhadap Perempuan
- Komisi Nasional Disabilitas
- Komisi Nasional Hak Asasi Manusia (Komnas HAM)
- Komisi Nasional Lanjut Usia
- Komisi Pemberantasan Tindak Pidana Korupsi
- Komisi Pemilihan Umum
- Komisi Penanggulangan AIDS Nasional
- Komisi Pengawas Haji Indonesia
- Komisi Pengawas Persaingan Usaha
- Komisi Penilai Analisis Mengenai Dampak Lingkungan
- Komisi Penyiaran Indonesia
- Komisi Penyuluhan Nasional
- Komisi Perlindungan Anak Indonesia
- Komite Akreditasi Nasional
- Komite Anti Dumping Indonesia
- Komite Ekonomi dan Industri Nasional
- Komite Industri Nasional
- Komite Kebijakan Industri Pertahanan
- Komite Kebijakan Percepatan Penyediaan Infrastruktur
- Komite Nasional Keamanan Penerbangan
- Komite Nasional Keselamatan Transportasi
- Komite Nasional Keuangan Syariah
- Komite Nasional Persiapan Pelaksanaan Masyarakat Ekonomi ASEAN
- Komite Pengamanan Perdagangan Indonesia
- Komite Percepatan dan Perluasan Pembangunan Ekonomi Indonesia
- Komite Perdagangan Nasional
- Komite Privatisasi Perusahaan Perseroan
- Komite Profesi Akuntan Publik
- Konsil Kedokteran Indonesia
- Konsil Tenaga Keperawatan
- Konsil Tenaga Kesehatan
- Lembaga Kerja Sama Tripartit
- Lembaga Pencegahan dan Pemberantasan Kerusakan Hutan
- Lembaga Perlindungan Saksi dan Korban
- Lembaga Produktivitas Nasional
- Lembaga Sensor Film
- Lembaga Sertifikasi Industri Hijau
- Majelis Disiplin Tenaga Kesehatan
- Majelis Pertimbangan Tenaga Nuklir
- Ombudsman Republik Indonesia
- Otoritas Jasa Keuangan
- Pusat Pelaporan dan Analisis Transaksi Keuangan
- Tim Koordinasi Misi Pemeliharaan Perdamaian
- Tim Nasional Percepatan Penanggulangan Kemiskinan
- Unit Kerja Presiden Pembinaan Ideologi Pancasila